独联体反恐中心的徽标是由独立国家联合体成员国安全和情报机关领导人理事会于2021年10月14日的决定批准的。
根据独联体成员国反恐中心会徽条例，独联体反恐中心徽标是官方标志，代表该组织活动和任务的地位、具体情况、官员和雇员的归属，以及独联体反恐中心的车辆、特殊设备和其他财产的所属关系。
徽章是一个银色的三角形细长盾牌，上角切出，并在盾牌的边缘处装有铆钉，上面叠加了一个带有金色边缘的银色盾牌，轮廓类似于向下延伸的三角形盾牌，后面是一把垂直放置在对称轴上的剑，尖端向下。
剑的剑柄和横杆是金色的，剑身是银色的。 盾牌区域是白色的。 在金色边缘的盾牌内部是独立国家联合体的标志，在两侧和底部由蓝色（或紫罗兰色）丝带围绕着，带子上有金色边框。 在盾牌区域周围上，用直立的金色大写字母写着“独立国家联合体”，在底部的丝带上用直立的金色大写字母写着“反恐中心”。
独联体反恐中心的徽标可以在单色图像的形式出现，可以放置在独联体成员国反恐中心的角标或带有角标的表格上。可以以彩色和单色或立体的方式进行复制。
徽标的图像按独联体反恐中心负责人确定的顺序放置在以下位置：独联体反恐中心占用的建筑物和房舍；独联体反恐中心的印章和纸张；独联体反恐中心设立的徽章和奖项；独联体反恐中心制作的官方出版物、电影、录像和照片材料；应独联体反恐中心要求制作的广告信息和纪念品产品，以及在举行独联体反恐中心活动的场所。
